Obwohl sie schon Mitte 50 sind, gehen die beiden Halligschipper Meike und Bernd Diedrichsen beruflich immer wieder auf große Fahrt. Die beiden betreiben von Husum aus eine kleine Reederei und bieten mit ihren Schiffen Fracht- und Touristenfahrten im Wattenmeer an. Da sie ihre Heimat, das Wattenmeer, erhalten wollen, lehnen sie Massentourismus ab. Deshalb fahren die Halligschipper mit kleinen Schiffen und nehmen nur eine begrenzte Zahl Touristen mit. Nebenbei versorgen sie die Halligbewohner. Mit ihrem Frachtschiff erneuern sie marode Reibepfähle in den Häfen, leeren die Sickergruben und bringen den Schiet anschließend ans Festland.
Seit fünf Jahren ist Meike mit an Bord. Sie verliebte sich während einer Touristenfahrt in Bernd, den Kapitän des Dampfers. Danach fuhr sie bei Bernd zunächst als Matrosin und legte dann ihr Kapitänspatent auf der Seefahrtschule in Flensburg ab. Seitdem Meike Kapitänin ist, haben die Halligschipper ihre kleine Reederei um zwei weitere Schiffe verdoppelt.
Mit dem historischen Ausflugsschiff MS "Rungholt" laufen sie kleine Halligen an, die von großen Dampfern nicht erreicht werden können. Mit ihrem zweiten neuen Schiff, einem kleinen Krabbenkutter, betreten die Halligschipper für sie absolutes Neuland. Obwohl Meike und Bernd noch nie gefischt haben, wollen sie mit ihrem Kutter Krabben an Land ziehen und im Hafen verkaufen. Den Kutter soll Meike als Kapitänin führen.
Mit einer Handvoll Touristen exklusiv zu den kleinen Halligen und neben ihrem Tagesgeschäft voller Touristenfahrten, Seebestattungen und Frachtfahrten auch noch Krabben fischen im Wattenmeer. Das ist das Leben der Halligschipper. Ein abenteuerliches Leben zwischen Ebbe und Flut.